| 序号 | 项目来源 | 项目（课题）名称 | 负责人 | 起止时间 |
| 1 | 国家“973”子课题 | 水稻重要农艺性状的功能基因组和分子基础研究 | 张宪省 | 2005-2009 |
| 2 | 国家“973”子课题 | 作物应答高盐、低温胁迫的分子调控机理 | 郑成超 | 2005-2009 |
| 3 | 国家“863” | 棉花耐盐基因的分离、功能鉴定与应用 | 郑成超 | 2005-2007 |
| 4 | 国家“863” | 优质高产抗逆农作物新品种选育及繁育技术研究——丰花五号花生新品种选育及繁育技术研究 | 万勇善 | 2005-2006 |
| 5 | 国家自然科学基金 | 一种棉花新型CCCH锌指转录因子的生物学功能分析 | 郑成超 | 2006-2008 |
| 6 | 国家自然科学基金 | 新型分子标记EST-SSR的开发和小麦遗传图谱的绘制 | 李斯深 | 2006-2008 |
| 7 | 国家自然科学基金 | 中间偃麦草中与小麦产量相关基因的鉴定及其染色体定位和分子标记 | 王洪刚 | 2006-2008 |
| 8 | 国家自然科学基金 | 水稻干旱、盐胁迫相关microRNAs的分离和表达调控分析 | 吴长艾 | 2006-2008 |
| 9 | 国家自然科学基金 | 小麦籽粒淀粉粒形成、结构与直支链淀粉合成的关系机制及其调节研究 | 王振林 | 2006-2008 |
| 10 | 国家自然科学基金 | 线粒体蛋白质与小麦细胞质雄性不育性 | 刘保申 | 2006-2008 |
| 11 | 国家自然科学基金 | 温度对RNA沉默的抑制及其分子机理研究 | 郭兴启 | 2006-2008 |
| 12 | 国家自然科学基金 | 利用小麦近等基因系对重要农艺性状主效QTL位点精细作图 | 刘树兵 | 2006-2008 |
| 13 | 国家自然科学基金 | 光合作用过程介导的活性氧发生与感真菌病烟草PCD的关系 | 高辉远 | 2006-2008 |
| 14 | 国家自然科学基金 | 玉米“根系拥挤效应”对产量影响的生理生态机制及其调控 | 王空军 | 2006-2008 |
| 15 | 国家自然科学基金 | ABA和PP2C调节牡丹和鸢尾花衰老的对比研究 | 钟 圆 | 2006-2007 |
| 16 | 国家自然科学基金 | 核酸序列同源性与RNA介导的病毒抗性关系研究 | 朱常香 | 2006-2007 |
| 17 | 农业结构调整重大技术研究专项 | 超级小麦新品种选育与示范 | 田继春 | 2005-2007 |
| 18 | 863 | 数字农业（江苏农科院、北京农业信息技术研究中心） | 王空军 | 2005-2006 |
| 19 | 国家十五攻关 | 小麦种质创新和新基因发掘 | 李斯深 | 2005-2006 |
| 20 | 国家十五攻关 | 鲁西地区小麦花生两熟制高效节水灌溉技术研究 | 李向东 | 2005-2006 |
| 21 | 山东省农业良种工程 | 高产优质抗逆专用玉米新品种培育 | 董树亭 | 2005-2007 |
| 22 | 山东省农业良种工程 | 高产优质抗逆超级小麦新品种培育 | 田纪春 | 2005-2007 |
| 23 | 国家粮食丰产科技工程 | 小麦玉米超高产栽培 | 于振文 | 2005-2006 |
| 24 | 国家粮食丰产科技工程 | 玉米小麦超高产栽培 | 王空军 | 2005-2006 |
| 25 | 国家粮食丰产科技工程 | 小麦超高产育种 | 田继春 | 2005-2006 |
| 26 | 省烟草局 | 烤烟集约化烘烤组织形式及配套技术研究与开发 | 温孚江 | 2005-2006 |
| 27 | 省烟草局 | 山东省烟草病虫害研究中心建设 | 温孚江 | 2005 |
| 28 | 教育部博士学科点专项科研基金 | 光合电子传递途径介导的活性氧对感病烟草细胞程序性死亡的调控 | 高辉远 | 2005-2007 |
| 29 | 教育部博士学科点专项科研基金 | 糖基化及二硫键对植酸酶稳定性的影响 | 王晓云 | 2005-2007 |
| 30 | 国家自然科学基金重点项目 | 提高小麦个体及群体光合效率和光合产物优化分配（中科院遗传发育所） | 杨兴洪 | 2005-2007 |
| 31 | 中科院遗传发育所 | 小麦遗传转化体系的建立和优化 | 王洪刚 | 2005-2006 |
| 32 | 省自然科学基金 | 小麦品种指标与植物营养的数量关系 | 尹燕枰 | 2005-2007 |
| 33 | 省科研奖励基金 | 喜温植物叶黄素循环关键酶基因的克隆及功能体系 | 李 滨 | 2005-2006 |
| 34 | 省中青年科学家科研基金 | 不同产量潜力基因型玉米籽粒库的生理生化演化规律研究 | 孙庆泉 | 2005-2007 |
| 35 | 省教育厅 | 保护地番茄多抗性砧木良种的选育 | 钟 圆 | 2005-2008 |
| 36 | 省农业厅 | 山东省中长期农业科技发展规划研究－农业科技问题研究专题 | 董树亭 | 2005-2006 |
| 37 | 山东圣丰种业科技有限公司 | 棉花转基因和转基因棉花检测 | 沈法富 | 2005-2007 |
| 38 | 科技部国际合作
斯洛伐克 | 光合机构适应环境胁迫的分子及生态机构 | 杨兴洪 | 2005-2007 |
| 39 | 美国BHN种子公司 | 西红柿优良品种引进和产业化开发 | 钟 圆 | 2005-2006 |
